2008年对棉农来说是悲惨的一年，在2007年和年初棉花价格高企的带动下，国内棉花种植面积增长。但随着金融危机的到来，纺织业遭重创，目前棉花收购价已低于成本价。在此形势下，2009年棉花种植面积减少成为不争的事实。
根据国家棉花市场监测系统2008年11～12月在全国范围内的调查，各省区植棉意向较上年普遍下降，2009年全国植棉意向面积为7128.32万亩，较上年减少1559.41万亩，降幅17.95%。
近年来棉花品种数量增长过快，已呈严重过剩状态，一个重要原因就是进入市场的新品种多，但优势品种无优势；经营企业多，但规模不大。种植品种数量多、布局乱、种植杂，不但造成栽培技术推广跟不上，棉农无所适从，而且棉花品质一致性差，收购价格不高，棉农收益低。
品种进入市场多退出慢
根据中国农科院棉花所统计显示，近两年国家和地方审定的品种总量为117～118个，不计重复审定有100个品种。品种来源更加广泛，除原来国家和省级科研机构外，来自公司和个人的品种数量正在快速增加。按一个品种使用寿命3～5年计算，全国一年种植的品种数量至少有600个。
但是各地仍继续增加区域试验规模，新品种审定数量快速增长的势头十分强劲。专家认为，国家和地方对新品种审定必须强调产量指标、品质指标和抗性指标的统一和协调，鉴于国内棉花枯萎病和黄萎病发生日益严重，在“两萎”病抗性方面应提出更严格的标准。更重要的是，严格审定制度是控制品种“多乱杂”的根本措施。
而品种退出机制实施以来，2007年农业部公布退出50个棉花品种，2008年农业部拟退出品种中没有棉花品种；据不完全统计，各地退出品种近100个。但这些退出品种多是20世纪80～90年代的老品种，对预防“旧瓶装新酒”有作用，但对控制品种“多乱杂”现象作用有限。
专家表示，利用好新品种，仅仅依靠区域试验远远不够。建议利用生产展示，从栽培角度研究适应性、综合抗性和丰产性来评价品种的科学利用价值，为终端用户——棉农品种选择提出建议和忠告。因此，品种的合理利用要提到棉花新品种推广的议事日程上来。
科研机构研发优势明显
近年来国内棉花品种已形成13个系列，即：中棉所、鲁棉、豫棉、鄂棉、冀棉、皖棉、晋棉、苏棉、蜀棉、新棉、湘棉、甘棉和辽棉。
2006年，新棉、鲁棉、中棉所、冀棉(含冀字号、邯字号、石字号)系列品种播种面积占全国棉花播种面积的16.7%、16.2%、14.2%和10.0%，苏棉(含苏字号、南字号和科字号)、湘棉和豫棉系列品种各为6.8%、5.6%和5.0%。以上7个系列品种(系)占全国棉花播种面积的73.8%。
2008年，鲁棉研(山东棉花中心)系列品种23个，占全国播种面积的15.7%；中棉所(中国农科院棉花所)系列品种31个，占全国播种面积的14.1%；邯郸(农科院)系列品种16个，占全国播种面积的5.2%。尽管国内棉花品种数量和种子公司不断增加，一些科研机构的优势仍然很明显。
优势品种优势下降
根据中国农科院棉花所等的统计，2004～2008年，全国棉花播种品种数量分别为266个、355个、456个、471个、579个，5年中品种数量增长了118%。而棉花种植面积2004～2007年分别为8539.5万亩、7592.85万亩、8113.65万亩、8300万亩(农业部统计)。在棉花种植面积基本维持在8000万亩的情况下，棉花品种数量增长超过1倍。
但是，占全国播种面积0.5%以上的优势品种面积在不断下滑。2005年优势品种(组合、系)42个，占全国面积的76.2%；2006优势品种(组合、系)53个，占全国棉花面积的68.2%；2007优势品种(组合、系)54个，占全国面积的64.4%；2008优势品种(组合、系)51个，占全国棉花面积的63.4%。4年中优势品种的份额下降了13.8个百分点。
2005年面积最大的“中棉所35”占全国棉花面积的7.8%，2006年面积最大的“中棉所35”占5.9%，2007年面积最大的“中棉所35”占6.0%，2008年面积最大的“鲁棉研28”占5.9%。优势品种的种植面积下降到6%以内，而且近4年全国没有一个品种的种植面积达到10%。
2006年美国陆地棉面积约7580万亩，陆地棉品种205个。中国2005年7592.85万亩的面积与美国接近，但棉花品种数量达355个。
专家分析认为，中国棉花优势品种无优势的重要原因是种子经营主体不具备实力。虽然中国棉种公司很多，但规模都很小，在科技创新、市场开拓、风险防范和应对方面还不具备实力，目前还没有哪个公司能够经营占全国10%种植面积的种子。
